도쿄. 이곳에는 인간의 모습으로 인간을 잡아먹는 "구울"이라는 괴물들이 살아가고 있다. 평소 독서를 좋아하는 대학생 카네키 켄은 단골 커피숍인 "안테이크"에서 카미시로 리제라는 소녀를 만난다. 둘은 나이, 경험뿐만 아니라 좋아하는 책까지 비슷하여 친해지게 된다. 하지만... 그녀와의 서점 데이트 이후 자신의 운명을 바꿔놓은 사고에 휘말려 "구울"의 기관을 이식받게 되는데...